More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4142 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  100 
 
 		 1046 aa  2125    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  29.28 
 
 		 1053 aa  289  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1023 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  28.59 
 
 		 1081 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1090 aa  250  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.82 
 
 		 1271 aa  218  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.13 
 
 		 2096 aa  181  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1352 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1600 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.38 
 
 		 3027 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 2035 aa  164  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.31 
 
 		 1595 aa  161  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1586 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  28.41 
 
 		 1953 aa  160  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.47 
 
 		 1614 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.94 
 
 		 2149 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.5 
 
 		 1572 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.4 
 
 		 1599 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.64 
 
 		 2277 aa  145  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2294 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1611 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1840 aa  134  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.28 
 
 		 1917 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 3193 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.77 
 
 		 1485 aa  128  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1550 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.2 
 
 		 1560 aa  125  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 3689 aa  124  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1547 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.28 
 
 		 924 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1942 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.62 
 
 		 1959 aa  122  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1669 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1259 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1551 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3273 aa  118  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1527 aa  118  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.36 
 
 		 1428 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  24.36 
 
 		 1579 aa  116  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1197 aa  115  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1565 aa  115  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1565 aa  115  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.26 
 
 		 1464 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 3073 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 913 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  25.71 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.8 
 
 		 2658 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.16 
 
 		 1509 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 927 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1467 aa  109  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1390 aa  108  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 2003 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.91 
 
 		 1732 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  24.61 
 
 		 613 aa  108  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.22 
 
 		 1381 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1528 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.44 
 
 		 1489 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.42 
 
 		 1539 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.17 
 
 		 1609 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1147 aa  106  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1531 aa  106  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.55 
 
 		 1528 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.31 
 
 		 1593 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  26.24 
 
 		 1368 aa  105  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.79 
 
 		 1379 aa  105  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.32 
 
 		 1362 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.37 
 
 		 1434 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.62 
 
 		 1485 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.07 
 
 		 1518 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  25.84 
 
 		 2349 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1834 aa  102  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.37 
 
 		 1388 aa  102  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.7 
 
 		 1626 aa  102  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1319 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1466 aa  101  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1492 aa  101  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25 
 
 		 1008 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.4 
 
 		 1639 aa  100  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1177 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25 
 
 		 1008 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.67 
 
 		 1568 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.24 
 
 		 2350 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2144 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  24.68 
 
 		 1437 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1654 aa  99  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  22.38 
 
 		 1422 aa  98.2  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  24.95 
 
 		 1345 aa  98.2  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  23.35 
 
 		 1446 aa  98.2  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  24.95 
 
 		 1345 aa  98.2  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1495 aa  98.2  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.59 
 
 		 1488 aa  97.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1268 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  24.58 
 
 		 1417 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  25.47 
 
 		 1429 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  23.23 
 
 		 1447 aa  97.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.15 
 
 		 6272 aa  96.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.36 
 
 		 2221 aa  96.3  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.57 
 
 		 1415 aa  96.3  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.16 
 
 		 1577 aa  95.9  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>