150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2271 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  89.84 
 
 
128 aa  230  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  71.09 
 
 
135 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  71.09 
 
 
128 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  71.09 
 
 
128 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  34.55 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  31.2 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  31.2 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
127 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
191 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  37.11 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  36.84 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  27.12 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.68 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  27.12 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  27.97 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  53.9  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  34.48 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
168 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.51 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.49 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  31.9 
 
 
179 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.27 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
232 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  33.03 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
181 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  34.04 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.68 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  34.78 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.9 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
213 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.66 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
137 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  27.05 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
176 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  41.57 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  28.83 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  32.61 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3833  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
302 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
161 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>