100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2073 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  100 
 
 		 497 aa  998    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  61.87 
 
 		 495 aa  682    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  24.1 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.05 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.36 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  32.54 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  30.73 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.28 
 
 		 758 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  21.9 
 
 		 356 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  30.41 
 
 		 553 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  26.71 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.21 
 
 		 598 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.34 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  27.34 
 
 		 448 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.05 
 
 		 607 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  26.61 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.33 
 
 		 584 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.26 
 
 		 349 aa  50.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.58 
 
 		 548 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  26.32 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.67 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  44.68 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  27.91 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  35.37 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  36.67 
 
 		 626 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  31.76 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  31.76 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  25.23 
 
 		 585 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  24.16 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.32 
 
 		 613 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  32.76 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  30.28 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.89 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  26.1 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.07 
 
 		 652 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.77 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.36 
 
 		 573 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.35 
 
 		 594 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  23.86 
 
 		 340 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.54 
 
 		 976 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  37.25 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.25 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  31.46 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  23.13 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  36.99 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.87 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.05 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  26.52 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  40 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  26.76 
 
 		 597 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  28.57 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.68 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  40 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  26.53 
 
 		 628 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.91 
 
 		 672 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3559  ABC transporter related  29.87 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000437899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.72 
 
 		 682 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  21.74 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  36.59 
 
 		 648 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0797  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 234 aa  44.7  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00354056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.16 
 
 		 613 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  23.95 
 
 		 596 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  32.29 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.17 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  32.29 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  32.91 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  32.29 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  32.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  27.19 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  31.25 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.25 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  41.67 
 
 		 708 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  24.82 
 
 		 600 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  30 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  26.12 
 
 		 508 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  21.05 
 
 		 255 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  46.15 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  44.19 
 
 		 359 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  30.08 
 
 		 619 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  47.06 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  47.06 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  30.84 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  43.48 
 
 		 643 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.05 
 
 		 280 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3031  DNA replication and repair protein RecF  36.19 
 
 		 359 aa  43.5  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  36.36 
 
 		 357 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  25.9 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  32.47 
 
 		 357 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  41.82 
 
 		 378 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  32.47 
 
 		 357 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  28 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  20.44 
 
 		 356 aa  43.5  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  32.31 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.56 
 
 		 605 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  22.95 
 
 		 339 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>