More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5652 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  74.8 
 
 		 516 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  76.39 
 
 		 516 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  64.58 
 
 		 520 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  100 
 
 		 508 aa  1030    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  64.97 
 
 		 520 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  64.58 
 
 		 520 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  55.08 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  54.72 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  54.69 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  53.1 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  53.11 
 
 		 534 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  54.8 
 
 		 511 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  53.8 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  49.9 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 559 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  38.96 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.43 
 
 		 513 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  37.72 
 
 		 525 aa  329  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 520 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 511 aa  319  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  38.02 
 
 		 527 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  36.17 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  36.59 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.8 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  35.23 
 
 		 515 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  38.22 
 
 		 517 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 545 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  40.16 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  35.97 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  38.87 
 
 		 527 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  36.11 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  39.73 
 
 		 533 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.76 
 
 		 506 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  38.74 
 
 		 533 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 534 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  38.94 
 
 		 509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  38.4 
 
 		 498 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 517 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  36.89 
 
 		 515 aa  309  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  39.34 
 
 		 533 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  35.99 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  35.76 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  36.13 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  37.25 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  37.04 
 
 		 551 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  35.5 
 
 		 518 aa  305  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  35.13 
 
 		 509 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  35.4 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  36.13 
 
 		 518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  36.42 
 
 		 604 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  35.99 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  37.18 
 
 		 529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  38.42 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  37.82 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 508 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  35.5 
 
 		 548 aa  302  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 508 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 516 aa  302  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 522 aa  302  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  36.27 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  37.84 
 
 		 533 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  37.5 
 
 		 532 aa  301  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 535 aa  300  4e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  37.62 
 
 		 512 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  37.88 
 
 		 534 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  34.77 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 512 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  36.02 
 
 		 511 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.85 
 
 		 528 aa  300  5e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 510 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  38.58 
 
 		 512 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  35.4 
 
 		 524 aa  299  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  37.57 
 
 		 533 aa  299  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  34.62 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  32.28 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 506 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  34.2 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  37.92 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  37.22 
 
 		 558 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  34.18 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 536 aa  297  3e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  34 
 
 		 510 aa  297  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  34.96 
 
 		 491 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>