More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0765 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  71.7 
 
 		 572 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  76.47 
 
 		 532 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  100 
 
 		 534 aa  1059    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  60.27 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  59.65 
 
 		 536 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  59.22 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  53.11 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 511 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  54.15 
 
 		 520 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  53.09 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  53.21 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  53.4 
 
 		 520 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  53.2 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  53.72 
 
 		 559 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 508 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.19 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  41.21 
 
 		 545 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 502 aa  340  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  38.69 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  42.58 
 
 		 604 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 505 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  37.28 
 
 		 509 aa  332  9e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.76 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  37.38 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.35 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  37.28 
 
 		 518 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.61 
 
 		 528 aa  329  6e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.51 
 
 		 525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  42.25 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  40.51 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 520 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 		 510 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  40.34 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 510 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  42.83 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  38.8 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  40.93 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 510 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  42.63 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 534 aa  324  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 510 aa  323  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  40.79 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  40.83 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  40.95 
 
 		 527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 534 aa  320  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  39.69 
 
 		 527 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  39.48 
 
 		 527 aa  319  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  36.77 
 
 		 510 aa  319  9e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  38.04 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  37.67 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  36.06 
 
 		 510 aa  317  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  40.56 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  41.3 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  41.62 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  37.01 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  39.43 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  35.63 
 
 		 503 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  35.15 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  36.35 
 
 		 509 aa  312  9e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  39.2 
 
 		 511 aa  312  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  40.79 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  38.99 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 522 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  41.15 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  39.06 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  36.54 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  39.96 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  41.67 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  40.31 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  34.66 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1244  ABC transporter related  43.16 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.21787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  34.23 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  37.14 
 
 		 517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  36.49 
 
 		 510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  34.71 
 
 		 507 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 519 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  39.42 
 
 		 533 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>