More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1164 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  91.49 
 
 		 511 aa  913    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  100 
 
 		 511 aa  1038    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  64.08 
 
 		 537 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  63.5 
 
 		 536 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  56.63 
 
 		 529 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.37 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  59.22 
 
 		 534 aa  557  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  57.61 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  56.61 
 
 		 572 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  54.8 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  54.64 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  54.44 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  53.85 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  53.86 
 
 		 559 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  53.69 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  52.89 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  43.03 
 
 		 512 aa  352  8.999999999999999e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  37.01 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 517 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  37.87 
 
 		 518 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  40.48 
 
 		 504 aa  329  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  39.29 
 
 		 525 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 511 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.7 
 
 		 511 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  40 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.84 
 
 		 528 aa  324  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 510 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 508 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  40.36 
 
 		 533 aa  322  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  39.17 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  36.42 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.64 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 510 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 510 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 510 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 510 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  37.31 
 
 		 545 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  35.94 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  35.19 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  38.61 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  38.29 
 
 		 527 aa  316  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  36.42 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  38.02 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  37.11 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  36.04 
 
 		 503 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 505 aa  309  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  39.31 
 
 		 524 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  34.33 
 
 		 507 aa  309  9e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  38.29 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  34.81 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  38.89 
 
 		 532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.29 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  37.8 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  38.26 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  35.17 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 511 aa  306  8.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  35.83 
 
 		 551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  39.49 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  36.88 
 
 		 547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  34.81 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  35.84 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  36.13 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  37.52 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  35.05 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  36.67 
 
 		 548 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  36.74 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  37.7 
 
 		 515 aa  300  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  38.27 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  36.06 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 502 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  37.8 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  36.13 
 
 		 529 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  31.7 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  37.5 
 
 		 506 aa  297  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  35.12 
 
 		 509 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  35.43 
 
 		 514 aa  296  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  35.27 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  33.2 
 
 		 510 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  36.71 
 
 		 534 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  33.6 
 
 		 520 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  37.38 
 
 		 515 aa  293  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  35.59 
 
 		 517 aa  293  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  34.44 
 
 		 509 aa  293  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  35.17 
 
 		 511 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>