More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5239 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  100 
 
 		 536 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  94.77 
 
 		 537 aa  1014    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  63.5 
 
 		 511 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  59.57 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  58.46 
 
 		 532 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  59.65 
 
 		 534 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  57.95 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  54.69 
 
 		 508 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  57.75 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  58.14 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  55.05 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  54.86 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  55.31 
 
 		 559 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.63 
 
 		 512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  39.08 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  39.53 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  42.88 
 
 		 504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.83 
 
 		 506 aa  339  9e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  38.81 
 
 		 518 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.41 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  37.45 
 
 		 520 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 510 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  42.74 
 
 		 551 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  41.75 
 
 		 604 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  39.84 
 
 		 515 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 510 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 510 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.26 
 
 		 525 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 508 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 508 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  37.92 
 
 		 509 aa  329  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  40.74 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 545 aa  326  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.99 
 
 		 528 aa  325  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  37.82 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  40.2 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  39.3 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  39.53 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  36.79 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  40.04 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.26 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  40.74 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  38.51 
 
 		 503 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  38.77 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 517 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  37.18 
 
 		 491 aa  316  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  38.7 
 
 		 503 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 523 aa  316  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 502 aa  316  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  39.39 
 
 		 529 aa  315  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  38.9 
 
 		 524 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  39.8 
 
 		 512 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  37.13 
 
 		 503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  37.11 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  39.38 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  40 
 
 		 518 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  37.94 
 
 		 509 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  36.6 
 
 		 510 aa  312  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  39.53 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  35.98 
 
 		 509 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  38.81 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 523 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  35.73 
 
 		 511 aa  310  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 507 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  39.92 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  38.06 
 
 		 547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4348  ABC transporter related  40.89 
 
 		 499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  34.86 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  39.73 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  37.6 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  39.92 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  37.4 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 		 512 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  34.95 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  37.03 
 
 		 551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  41.13 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  40.35 
 
 		 512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  36.81 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  37.85 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  36.81 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 		 535 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  36.12 
 
 		 521 aa  303  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>