More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6451 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  64.27 
 
 
520 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  93.41 
 
 
516 aa  953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  76.39 
 
 
508 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  100 
 
 
516 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  64.01 
 
 
520 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  64.2 
 
 
520 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 
509 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  55.05 
 
 
536 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  55.47 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  53.24 
 
 
529 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  53.09 
 
 
534 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  51.56 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 
511 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  52.89 
 
 
511 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  49.05 
 
 
572 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 
559 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
520 aa  340  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  37.39 
 
 
513 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.92 
 
 
512 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  37.23 
 
 
525 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  37.47 
 
 
505 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  35.29 
 
 
491 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  36.4 
 
 
509 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  36.4 
 
 
518 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.25 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
523 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  34.44 
 
 
515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 
510 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.01 
 
 
510 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  37.68 
 
 
527 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  34.89 
 
 
510 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
545 aa  309  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
510 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
510 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  36.09 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  38.73 
 
 
533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  39.09 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  36.33 
 
 
527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.53 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 
529 aa  307  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  36.98 
 
 
504 aa  306  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  35.71 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  36.35 
 
 
547 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
511 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
517 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  34.13 
 
 
509 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
507 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  38.49 
 
 
533 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
535 aa  301  1e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  35.19 
 
 
518 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 
534 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
522 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  34.67 
 
 
513 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  36.33 
 
 
515 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  35.43 
 
 
509 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
506 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
511 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
501 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  37.33 
 
 
517 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  36.25 
 
 
509 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  34.71 
 
 
520 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  36.33 
 
 
517 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  36.42 
 
 
551 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  38.11 
 
 
533 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  35.48 
 
 
604 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  35.55 
 
 
518 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  34.15 
 
 
491 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  36.92 
 
 
533 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  33.86 
 
 
509 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  36.21 
 
 
527 aa  296  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  37.65 
 
 
505 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  34.91 
 
 
548 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  37.6 
 
 
524 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  37.06 
 
 
509 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  35.53 
 
 
511 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  34.78 
 
 
509 aa  296  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  34.36 
 
 
541 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  34.2 
 
 
510 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  35.06 
 
 
503 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  37.23 
 
 
509 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  34.95 
 
 
528 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  36.58 
 
 
512 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  38.09 
 
 
504 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  36.58 
 
 
512 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  33.81 
 
 
511 aa  293  7e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  34.93 
 
 
532 aa  293  7e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  35.91 
 
 
513 aa  292  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  35.8 
 
 
534 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  36.01 
 
 
512 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>