More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1706 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4479  ABC transporter related  64.59 
 
 		 516 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1706  ABC transporter related  100 
 
 		 520 aa  1031    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.76456 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5652  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  64.58 
 
 		 508 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.027963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1110  ABC transporter related  97.31 
 
 		 520 aa  1007    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434413  normal  0.608996 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6451  ABC transporter related  64.01 
 
 		 516 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0328742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2025  ABC transporter related  98.85 
 
 		 520 aa  1020    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4624  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.48 
 
 		 509 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0849  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1372  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  57.75 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5239  ABC transporter related  57.75 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0274  ABC transporter related  55.75 
 
 		 532 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0765  ABC transporter  53.21 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1355  ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 511 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1164  ABC transporter  53.85 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.345716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0840  ABC transporter related  52.68 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3022  ABC transporter-related protein  53.07 
 
 		 559 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  42.19 
 
 		 551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  41.3 
 
 		 504 aa  339  8e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  40.95 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  41.63 
 
 		 604 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.14 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  39.92 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 		 534 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 520 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  38.72 
 
 		 548 aa  323  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  36.68 
 
 		 513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  36.76 
 
 		 527 aa  319  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  35.45 
 
 		 518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.82 
 
 		 506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.69 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  41.26 
 
 		 524 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  39.17 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  36.67 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  36.99 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  37.8 
 
 		 524 aa  313  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  39.33 
 
 		 527 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  35.05 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.59 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  36.58 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  38.66 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  35.2 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  37.11 
 
 		 511 aa  309  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  35.42 
 
 		 509 aa  309  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  38.46 
 
 		 541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  36.83 
 
 		 547 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 		 522 aa  306  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  40.55 
 
 		 512 aa  306  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  35.14 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  39.92 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  37.57 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  39.8 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  35.62 
 
 		 518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  35.36 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  39.01 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  34.83 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  38.24 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 		 519 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  36.11 
 
 		 507 aa  300  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  36.11 
 
 		 507 aa  300  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  39.49 
 
 		 533 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1182  ABC transporter related  37.35 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  36.51 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  37.55 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  37.45 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  33.79 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  38.18 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  36.51 
 
 		 503 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 		 511 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  37.88 
 
 		 533 aa  296  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  33.4 
 
 		 515 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  33.93 
 
 		 509 aa  296  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 510 aa  296  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 		 510 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  33.74 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  35.19 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  33.73 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  36.44 
 
 		 513 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 512 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  37.65 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  37.02 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 507 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 517 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  39.61 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 510 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>