More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3151 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1244  ABC transporter related  70.65 
 
 
533 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.21787 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5419  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  66.21 
 
 
531 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2077  ABC transporter related  69.77 
 
 
529 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0945208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  100 
 
 
533 aa  1039    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  50.3 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  48.15 
 
 
512 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  43.85 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  43.11 
 
 
509 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  46.94 
 
 
517 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  45.47 
 
 
525 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  45.1 
 
 
511 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  43.85 
 
 
509 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
508 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  43.96 
 
 
509 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  42.89 
 
 
510 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
501 aa  422  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
510 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  46.31 
 
 
527 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
510 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
510 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
510 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  46.83 
 
 
498 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.63 
 
 
528 aa  413  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
510 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
510 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.36 
 
 
545 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42.86 
 
 
510 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  46.23 
 
 
558 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
510 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  42.15 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.78 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44.23 
 
 
548 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.86 
 
 
518 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  41.32 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.7 
 
 
518 aa  401  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  45.78 
 
 
507 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  40.56 
 
 
507 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  44.71 
 
 
511 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  45.09 
 
 
509 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  46.95 
 
 
541 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.55 
 
 
528 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  46.73 
 
 
506 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
505 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  42.71 
 
 
513 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.74 
 
 
551 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.22 
 
 
512 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  44.74 
 
 
510 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  45.88 
 
 
509 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  41.05 
 
 
510 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  43.4 
 
 
491 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
534 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  40.36 
 
 
509 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  46.03 
 
 
533 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  46.12 
 
 
525 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
511 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  44.53 
 
 
551 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  45.37 
 
 
525 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.67 
 
 
520 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
511 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.37 
 
 
525 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  45.74 
 
 
527 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  44.44 
 
 
503 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
511 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  44.25 
 
 
503 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
506 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
520 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.94 
 
 
527 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  43.77 
 
 
604 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
524 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  43.83 
 
 
513 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.28 
 
 
506 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  44.07 
 
 
509 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
523 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
502 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  41.22 
 
 
514 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  37.76 
 
 
514 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41.8 
 
 
547 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  40.08 
 
 
521 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  44.23 
 
 
532 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  44.08 
 
 
534 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.68 
 
 
507 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.68 
 
 
507 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
522 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.51 
 
 
516 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
514 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  41.91 
 
 
511 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  44.83 
 
 
504 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
534 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  42.43 
 
 
524 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  46.74 
 
 
546 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  43.37 
 
 
508 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
511 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
506 aa  369  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
532 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  43.17 
 
 
515 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  43.99 
 
 
508 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>