More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4106 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 453 aa  902    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  64.91 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 357 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  34.89 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 371 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 353 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  34.44 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 		 676 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  33.75 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  49.23 
 
 		 1399 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  51.3 
 
 		 1008 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  48.44 
 
 		 1110 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  47.24 
 
 		 1407 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  47.79 
 
 		 650 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  45.59 
 
 		 649 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 769 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.26 
 
 		 1418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 3706 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 461 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 361 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  35.29 
 
 		 344 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 783 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 360 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 771 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 872 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  46.9 
 
 		 971 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 878 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.92 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 1239 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1654 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.05 
 
 		 744 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 764 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 681 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 488 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 357 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 771 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  34.2 
 
 		 387 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 616 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 839 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 871 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.82 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 788 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 2693 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 348 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 541 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 732 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 815 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 350 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1093 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1390 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 492 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 		 1253 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 746 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1093 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 752 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 613 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>