More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3728 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 406 aa  828    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  63.79 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  51.86 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  52.62 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  51.24 
 
 		 381 aa  363  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 		 405 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  48.49 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 420 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 408 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 		 739 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 1654 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.69 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 875 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.91 
 
 		 744 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 874 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1390 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.56 
 
 		 895 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 864 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 681 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1560 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 872 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 618 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 3706 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 572 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.82 
 
 		 1668 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 871 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 2693 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 1676 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 941 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 361 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 839 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.96 
 
 		 783 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 462 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 1093 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 1093 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  36.07 
 
 		 657 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 732 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 723 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 834 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  34.67 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 815 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 1253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1177 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 771 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 613 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 		 982 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 739 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 1714 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 642 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 771 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1210 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 603 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 1239 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 945 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 674 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 729 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 991 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 709 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 782 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.06 
 
 		 754 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 764 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  33.49 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 909 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 752 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.35 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>