182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0129 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  100 
 
 		 330 aa  626  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  57.66 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  54.52 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  55.49 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  53.44 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  53.44 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  53.01 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  56.97 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  34.77 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  34.04 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  36.66 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.66 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  35.17 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  31.69 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.6 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  30.09 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.43 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.78 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  29.27 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.03 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.42 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.59 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.5 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  29.7 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.92 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  33.04 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  30.75 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.96 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.61 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  30.94 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  30.54 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.93 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.79 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.64 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  32.45 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  28.61 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  30.39 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.17 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.85 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  21.69 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.19 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.88 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.78 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  30 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.7 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>