More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6779 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  68.27 
 
 		 661 aa  864    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  84.38 
 
 		 663 aa  1028    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  69.26 
 
 		 661 aa  854    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  100 
 
 		 665 aa  1288    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  68.58 
 
 		 661 aa  867    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  68.3 
 
 		 652 aa  810    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  46.35 
 
 		 677 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  46.21 
 
 		 674 aa  505  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  42.65 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  39.97 
 
 		 653 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  34.98 
 
 		 643 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  34.95 
 
 		 671 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 622 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  34.34 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  34.21 
 
 		 639 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  34.06 
 
 		 639 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  34.56 
 
 		 620 aa  302  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  34.04 
 
 		 637 aa  287  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.13 
 
 		 653 aa  286  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33.63 
 
 		 632 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  35.46 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 702 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  33.1 
 
 		 615 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.81 
 
 		 595 aa  251  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  31.15 
 
 		 789 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.46 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  30.1 
 
 		 593 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.69 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  30.43 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  28.5 
 
 		 613 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.6 
 
 		 627 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  32.92 
 
 		 595 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  28.57 
 
 		 594 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  29.84 
 
 		 607 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.41 
 
 		 633 aa  203  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  29.67 
 
 		 607 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.51 
 
 		 670 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  30.57 
 
 		 571 aa  183  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.59 
 
 		 779 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  29.21 
 
 		 598 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 610 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  29.24 
 
 		 709 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.62 
 
 		 610 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  26.83 
 
 		 576 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 618 aa  140  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 582 aa  137  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  27.3 
 
 		 583 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  29.74 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  26.79 
 
 		 580 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  26.59 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  26.59 
 
 		 583 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.28 
 
 		 574 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.81 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  27.01 
 
 		 575 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 609 aa  120  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  27.99 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  27.78 
 
 		 607 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  29.16 
 
 		 579 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  28.05 
 
 		 579 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.91 
 
 		 793 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.64 
 
 		 806 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.64 
 
 		 793 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.68 
 
 		 820 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  24.56 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.11 
 
 		 584 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25 
 
 		 597 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.29 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 596 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 629 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 		 750 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 		 765 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.79 
 
 		 657 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  23.63 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  24.09 
 
 		 593 aa  102  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.84 
 
 		 777 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  25.86 
 
 		 1002 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.89 
 
 		 808 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  27.53 
 
 		 677 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  27.53 
 
 		 677 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  26.06 
 
 		 612 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.47 
 
 		 781 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.47 
 
 		 803 aa  99.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 752 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25.6 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.36 
 
 		 848 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.63 
 
 		 920 aa  98.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  24.11 
 
 		 785 aa  97.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  23.67 
 
 		 765 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 702 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 760 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  27.02 
 
 		 585 aa  94.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.8 
 
 		 751 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  27.44 
 
 		 601 aa  94.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.4 
 
 		 770 aa  93.6  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.81 
 
 		 791 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.11 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>