More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1882 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  74.29 
 
 		 523 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  99.04 
 
 		 520 aa  1004    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  100 
 
 		 520 aa  1013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  100 
 
 		 520 aa  1013    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  66.67 
 
 		 522 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  49.72 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  47.65 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  47.15 
 
 		 533 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  49.81 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  47.9 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  47.24 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  37.2 
 
 		 508 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  42.38 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  41.23 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  39.84 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  40.78 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  40.2 
 
 		 521 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  39.55 
 
 		 525 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  39.55 
 
 		 525 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  38.33 
 
 		 498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  40.11 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  39.32 
 
 		 527 aa  309  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  38.25 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  37.95 
 
 		 521 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  38.87 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  38.87 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  38.87 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  40.35 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  38.28 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  39.29 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  44.29 
 
 		 520 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  38.72 
 
 		 514 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  37.89 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  37.89 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  34.18 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  38.99 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  37.83 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  30.32 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  32.92 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  32.85 
 
 		 571 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  32.61 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  31.03 
 
 		 575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  32.02 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  32.13 
 
 		 595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  33.2 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  31.23 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  31.23 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  31.91 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  32.39 
 
 		 574 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  31.4 
 
 		 577 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  31.23 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  31.33 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  31.48 
 
 		 576 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  31.79 
 
 		 575 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  31.03 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  40 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  39.6 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  39.6 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  39.6 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  39.6 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  38.98 
 
 		 369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  38.8 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  39.44 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  36.82 
 
 		 303 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  37.68 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  34.96 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  38.36 
 
 		 310 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  34.8 
 
 		 308 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  34.8 
 
 		 308 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  35.37 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  37.44 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.36 
 
 		 289 aa  134  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  38.19 
 
 		 285 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  37.38 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  37.5 
 
 		 292 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  34.91 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  37.1 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  35.06 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  37.45 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  37.16 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  36.69 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  36.15 
 
 		 295 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  38.54 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  35.27 
 
 		 817 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  26.93 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  37.5 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  37.5 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  37.5 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  34.21 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  32.41 
 
 		 280 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  32.24 
 
 		 279 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  33.47 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  32.77 
 
 		 304 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  33.17 
 
 		 308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>