More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2372 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 642 aa  1310    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  35.45 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  32.92 
 
 		 678 aa  331  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  33.44 
 
 		 680 aa  330  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  34.69 
 
 		 662 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 715 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  33.5 
 
 		 615 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 710 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  26.24 
 
 		 687 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.7 
 
 		 667 aa  184  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  24.88 
 
 		 718 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  27.58 
 
 		 670 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 643 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  37 
 
 		 702 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 679 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 653 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.76 
 
 		 641 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  40.61 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 687 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 715 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  24.57 
 
 		 704 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 649 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 635 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 714 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 707 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  35.11 
 
 		 704 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 715 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  24.02 
 
 		 702 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 613 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  37.09 
 
 		 684 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 893 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  23.38 
 
 		 696 aa  101  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.59 
 
 		 698 aa  98.2  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.44 
 
 		 656 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.44 
 
 		 1023 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.51 
 
 		 716 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  36.22 
 
 		 656 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 665 aa  91.3  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 681 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  35.88 
 
 		 668 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.53 
 
 		 659 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  29.53 
 
 		 641 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 614 aa  90.5  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.53 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 634 aa  90.5  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 		 670 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.57 
 
 		 618 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  33.33 
 
 		 673 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  32.51 
 
 		 628 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.63 
 
 		 646 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 688 aa  89.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 682 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 617 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.24 
 
 		 732 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.77 
 
 		 640 aa  88.6  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 697 aa  87.8  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  31.19 
 
 		 652 aa  87.4  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 611 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  34.97 
 
 		 613 aa  87.4  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 616 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 762 aa  87.4  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  39.86 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.09 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.09 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 648 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.09 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.09 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 1128 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.09 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23 
 
 		 655 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 637 aa  85.5  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  37.01 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 706 aa  83.6  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 671 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 670 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  38.56 
 
 		 713 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  28.78 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 668 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  35.17 
 
 		 704 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 740 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 699 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.41 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>