More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1897 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1225    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.9 
 
 		 1764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.39 
 
 		 648 aa  114  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  25.27 
 
 		 636 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  24.26 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  24.41 
 
 		 625 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.73 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.73 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  26.06 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  24.19 
 
 		 604 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  25.64 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  23.09 
 
 		 527 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  23.77 
 
 		 669 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  23.94 
 
 		 530 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  24.25 
 
 		 725 aa  94  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 573 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  25.54 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  22.36 
 
 		 532 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 538 aa  91.3  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  28.26 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.88 
 
 		 1694 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.48 
 
 		 695 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  24.04 
 
 		 677 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  25.41 
 
 		 663 aa  87.8  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 530 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  23.42 
 
 		 637 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  25.27 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 927 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  23.77 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  44.94 
 
 		 465 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  22.11 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  22.29 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 4079 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  22.01 
 
 		 594 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 878 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 697 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 608 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.58 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  22.95 
 
 		 742 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 		 810 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 		 1979 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  23.95 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1276 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.28 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  24.19 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  20.69 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1297 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1827 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  24.69 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1085 aa  67.8  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.18 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 808 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1094 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  21.17 
 
 		 484 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  21 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  19.28 
 
 		 502 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.75 
 
 		 745 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 297 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 297 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1450 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 3145 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.6 
 
 		 1056 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 3560 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  22.1 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.36 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 968 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  21.83 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.66 
 
 		 1022 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.11 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1138 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 836 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.24 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1069 aa  63.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.59 
 
 		 293 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 1737 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.86 
 
 		 622 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  24.75 
 
 		 889 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  24.51 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.5 
 
 		 142 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  20.77 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>