259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0424 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  91.42 
 
 		 374 aa  714    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  88.19 
 
 		 365 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  100 
 
 		 373 aa  761    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  90.08 
 
 		 374 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  56.49 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  56.76 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  55.14 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  54.81 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  51.8 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  51.04 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  51.34 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  45.31 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  45.45 
 
 		 369 aa  328  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.71 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  43.29 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  40.87 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.05 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  40.79 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  40.26 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  40.11 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  40.73 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  42.73 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  37.87 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  38.99 
 
 		 375 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  39.21 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  37.82 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  40.23 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  38.96 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.06 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  38.76 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  40.52 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  38.17 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  38.75 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  38.6 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  38.67 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 689 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  37.4 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.74 
 
 		 688 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  37.35 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.79 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  35.25 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  38.04 
 
 		 337 aa  223  6e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.16 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.75 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.75 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.81 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.94 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  30.41 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.12 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  27 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.67 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.79 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.41 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  27.64 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.37 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.2 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.32 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.2 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.77 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.15 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.06 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.16 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.1 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.65 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.38 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.28 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  22.32 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  20.7 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.08 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>