More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2625 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  33.24 
 
 		 1024 aa  668    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  50.19 
 
 		 1068 aa  1042    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.73 
 
 		 1052 aa  847    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1048 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  41.79 
 
 		 1042 aa  815    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1041 aa  778    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  43.16 
 
 		 1069 aa  850    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  42.94 
 
 		 1039 aa  798    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  43.23 
 
 		 1045 aa  828    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  39.89 
 
 		 1057 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1067 aa  2107    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  41.66 
 
 		 1033 aa  751    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  42.53 
 
 		 1044 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  42.28 
 
 		 1034 aa  791    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  41.07 
 
 		 1038 aa  770    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1038 aa  622  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.87 
 
 		 1032 aa  617  1e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.65 
 
 		 1025 aa  547  1e-154  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1092 aa  499  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1043 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  48.17 
 
 		 1189 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  29.22 
 
 		 1134 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 		 1335 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  45.93 
 
 		 1267 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  29.02 
 
 		 1165 aa  416  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1146 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1044 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1050 aa  337  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1011 aa  334  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1034 aa  320  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1006 aa  318  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1028 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1014 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1040 aa  317  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1470 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1044 aa  307  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1055 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1034 aa  301  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1043 aa  297  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1025 aa  297  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1032 aa  296  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 		 1041 aa  296  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1030 aa  295  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1041 aa  295  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1020 aa  295  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 1496 aa  293  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1050 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1034 aa  291  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1020 aa  290  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1033 aa  290  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.71 
 
 		 1036 aa  290  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1290 aa  288  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1036 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1101 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  23.89 
 
 		 1053 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.54 
 
 		 1038 aa  284  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1022 aa  283  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  24.2 
 
 		 1029 aa  282  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.78 
 
 		 1046 aa  279  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1028 aa  279  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  24.1 
 
 		 1026 aa  277  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  25.99 
 
 		 1044 aa  277  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1029 aa  277  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1064 aa  274  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 		 1038 aa  274  8.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  27.57 
 
 		 1064 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  24.43 
 
 		 1095 aa  272  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.88 
 
 		 1027 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1008 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.95 
 
 		 1024 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1071 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1063 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1063 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1063 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25 
 
 		 1067 aa  269  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.7 
 
 		 1052 aa  270  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1063 aa  269  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1063 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1070 aa  268  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1022 aa  268  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.26 
 
 		 1043 aa  268  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.21 
 
 		 1063 aa  267  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.07 
 
 		 1069 aa  266  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1023 aa  266  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.14 
 
 		 1024 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1067 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1074 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  25.35 
 
 		 1025 aa  265  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  25.65 
 
 		 1039 aa  264  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1033 aa  264  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1067 aa  264  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  23.68 
 
 		 1026 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1028 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1067 aa  262  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1027 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1028 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  23.78 
 
 		 1038 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1015 aa  261  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1046 aa  261  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1016 aa  261  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>