More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3637 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 213 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.33 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  19.26 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  36.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3444  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  37.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  38.3 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  37.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>