More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0569 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  100 
 
 		 391 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  98.01 
 
 		 352 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  78.11 
 
 		 370 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  66.37 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  53.66 
 
 		 363 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  52.94 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  50.15 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  51.04 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.08 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  45.4 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.79 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.48 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  46.67 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  45.62 
 
 		 367 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.2 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.9 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.45 
 
 		 342 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.41 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.34 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  45.05 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.08 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.76 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.88 
 
 		 366 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  45.36 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.73 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  48.31 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.18 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.73 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  41.21 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.03 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.73 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  43.41 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.86 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  38.75 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.44 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  47.1 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.4 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.88 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  43.18 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.86 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.21 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  42.09 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.29 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  43.57 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  48.01 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  39.13 
 
 		 349 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  43.79 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  41.79 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  39.44 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  43.91 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.86 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  44.13 
 
 		 345 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  48.79 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  40.48 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  42.6 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.6 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.8 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  42.86 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.89 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.41 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  40.94 
 
 		 353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  42.76 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  39.52 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  49.65 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  42.49 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  42.95 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  41.88 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  39.69 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  45.73 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  39.94 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  41.03 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.81 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  41.69 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  43.04 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  40.8 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  40.49 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  46.03 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  40.8 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  42.99 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.45 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  37.65 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  42.22 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  40.76 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.92 
 
 		 365 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  39.94 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.64 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>