More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3322 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  880    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  57.14 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  57.14 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  48.6 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  48.17 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  47.94 
 
 		 406 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 416 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  39.25 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  33.99 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  35.36 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  34.29 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.59 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 413 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 409 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  36.28 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  35.89 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 427 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  36.67 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  36.67 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  33.79 
 
 		 440 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  36.68 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  36.62 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 432 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  36.43 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  34.62 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.73 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  33.89 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  35.1 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.17 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  31.96 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.43 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  30.02 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.71 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.57 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  29.59 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  29.62 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.99 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.57 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  28.81 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  26.92 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.31 
 
 		 415 aa  156  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  26.09 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  26.33 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  26.25 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  29.9 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  26.01 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.27 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  28.85 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.54 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>