More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0434 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 333 aa  668    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  28.67 
 
 		 535 aa  109  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  29.15 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  30.52 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 548 aa  93.6  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  26.07 
 
 		 526 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  28.25 
 
 		 523 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 536 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  27.35 
 
 		 523 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  27.8 
 
 		 523 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.51 
 
 		 529 aa  85.9  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  25.76 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  24.73 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  25.1 
 
 		 667 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.85 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  25.54 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.84 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.05 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.55 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  29.83 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  22.98 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.91 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  22.86 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  23.71 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  23.43 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  22.91 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  22.88 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.6 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  24.14 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  25.12 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 843 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  23.78 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  23.21 
 
 		 1144 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  22.56 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  23.79 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  22.75 
 
 		 861 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  19.4 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  23.44 
 
 		 1133 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  21.52 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  27.81 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.92 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.91 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  25.38 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  23.47 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  22.26 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  26.54 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  22.66 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.92 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  23.28 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  25.73 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.91 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>