223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01216 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  54.3 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  50.45 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  50.22 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  51.12 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  49.78 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  50.22 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  38.39 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  31.8 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  32.27 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.48 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30.56 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30.33 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  31.53 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  32.89 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  32.57 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  31.11 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  29.2 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  30.84 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  29.6 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  29.63 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  30.88 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  30.22 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  30.45 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  35.81 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  29.17 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  29.55 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  30.23 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  31.3 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.63 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  27.11 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  29.28 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  31.67 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  27.78 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  27.78 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  31.19 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  26.67 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  28.83 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  29.02 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  28.77 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  30.28 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  32.3 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  32.3 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  31.14 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  27.83 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  30.59 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  30.88 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  27.91 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  29.44 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  29.82 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  27.15 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  31.86 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  30.14 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  30.14 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  26.94 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  30.14 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  27.23 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  29.22 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  30.09 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  28.83 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  24.54 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  30.36 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  28 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  28.76 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  27.19 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  27.44 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  27.19 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  25.66 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  27.35 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  29.18 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.63 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  26.7 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  27.83 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  28.14 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  27.31 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  27.23 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  28.71 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  27.6 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  27.03 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  28.32 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.91 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  26.87 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  27.88 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  29.46 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  26.39 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.53 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.31 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.66 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.13 
 
 		 167 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.31 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.08 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.27 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.75 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  23.26 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>