203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4334 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  43.17 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  60 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  54.55 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  59.68 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  39.82 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  61.54 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  34.35 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  62.26 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  58.49 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  55 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  36.59 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  31.69 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  33.33 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  58.93 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  50.77 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  49.09 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34.81 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  34.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  42.19 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  54.72 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  44.78 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  32.41 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  36.15 
 
 
283 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  45.59 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.29 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  43.33 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  31.25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  38.74 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  50.94 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  42.11 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  43.94 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  30.43 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.22 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  43.42 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  45 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  44.78 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  46.94 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.5 
 
 
300 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  30.22 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  33.64 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.01 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  36.59 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  43.28 
 
 
130 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  47.06 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  56.25 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  53.06 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.38 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  56.25 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  29.05 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.41 
 
 
207 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  29.19 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  48.98 
 
 
125 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  30 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.68 
 
 
208 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  38.82 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  30.56 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  27.89 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  34.91 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  27.66 
 
 
217 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.77 
 
 
300 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  40.68 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.35 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  27.34 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.52 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  30.28 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.14 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.52 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.17 
 
 
288 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.72 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  51.06 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.74 
 
 
290 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  30.56 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  36.49 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  39.62 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  30.56 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  30.56 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.59 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  28.06 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.21 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  29.92 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.17 
 
 
152 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.43 
 
 
154 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  30.28 
 
 
201 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.15 
 
 
297 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>