177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22850 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
499 aa  976    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  35.73 
 
 
430 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
512 aa  170  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
489 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.77 
 
 
517 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  29.15 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
529 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
453 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.6 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
441 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
494 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
460 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
435 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
459 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
498 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 
514 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.23 
 
 
496 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 
495 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
461 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
423 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  33.51 
 
 
407 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  32.94 
 
 
435 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  32.94 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
440 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  31.65 
 
 
490 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  19.72 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  20.86 
 
 
495 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 
484 aa  87.4  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
482 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
468 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.24 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
498 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  21.28 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
471 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 
474 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 
504 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 
505 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  21.38 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.54 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  23.81 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 
486 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.88 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  36.7 
 
 
135 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
489 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
476 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
500 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2873  O-antigen and teichoic acid-like export protein  20.12 
 
 
508 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.427284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
480 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
463 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
479 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
499 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
482 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  18.34 
 
 
522 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
429 aa  57.4  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
474 aa  57.4  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2783  polysaccharide biosynthesis protein  19.94 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
516 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  29.64 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 
431 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
506 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>