More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6024 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6024  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
390 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.42 
 
 
476 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.76 
 
 
464 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.22 
 
 
471 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.12 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.79 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.59 
 
 
485 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.94 
 
 
524 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  38.81 
 
 
520 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.94 
 
 
524 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.03 
 
 
483 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.16 
 
 
462 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.81 
 
 
483 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  35.81 
 
 
483 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.41 
 
 
476 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.77 
 
 
476 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  37.08 
 
 
578 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.87 
 
 
466 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  37.39 
 
 
588 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.11 
 
 
498 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.41 
 
 
476 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.32 
 
 
461 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  40.6 
 
 
528 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.17 
 
 
479 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  41.79 
 
 
516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.45 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.6 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  36.12 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.59 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.42 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.5 
 
 
492 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.5 
 
 
477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  36.78 
 
 
489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.64 
 
 
469 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.93 
 
 
508 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  40.88 
 
 
501 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.67 
 
 
467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.27 
 
 
522 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  40 
 
 
506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.78 
 
 
478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.14 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  41.61 
 
 
511 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.61 
 
 
511 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  38.46 
 
 
500 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.36 
 
 
474 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  35.76 
 
 
523 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.61 
 
 
511 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.91 
 
 
500 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.79 
 
 
474 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  37 
 
 
472 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.38 
 
 
479 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.66 
 
 
514 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
482 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.57 
 
 
474 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  38.26 
 
 
520 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  35.45 
 
 
500 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.57 
 
 
474 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.15 
 
 
501 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  37.03 
 
 
485 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  34.54 
 
 
501 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  41.13 
 
 
489 aa  192  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  37.65 
 
 
515 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  39.52 
 
 
506 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  39.35 
 
 
388 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  39.52 
 
 
493 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 
477 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 
477 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.86 
 
 
481 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  36.46 
 
 
473 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.05 
 
 
382 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  39.55 
 
 
502 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.3 
 
 
473 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  34.34 
 
 
503 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  34.41 
 
 
518 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  34.16 
 
 
485 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  38.89 
 
 
492 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.14 
 
 
493 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.42 
 
 
481 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  39.56 
 
 
535 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  38.06 
 
 
513 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  38.06 
 
 
513 aa  186  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 
384 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42.47 
 
 
524 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  41.75 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.02 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.86 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 
473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.32 
 
 
386 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  36.46 
 
 
502 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  38.95 
 
 
523 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.23 
 
 
498 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.71 
 
 
493 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  36.15 
 
 
476 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  42.12 
 
 
524 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 
464 aa  182  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35 
 
 
381 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  35.84 
 
 
501 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  35.56 
 
 
490 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  36.4 
 
 
497 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>