More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4270 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 880 aa  1781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  41.81 
 
 		 737 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 727 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 727 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 729 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 730 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 751 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 738 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 764 aa  337  7.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 782 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.91 
 
 		 705 aa  159  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 709 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 683 aa  138  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 683 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 683 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 700 aa  134  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 683 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 684 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 684 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 684 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.15 
 
 		 683 aa  115  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 684 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 696 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 688 aa  97.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.05 
 
 		 777 aa  94  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 774 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 720 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  24.01 
 
 		 782 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 675 aa  91.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 710 aa  91.3  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.05 
 
 		 809 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.05 
 
 		 809 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.5 
 
 		 712 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 711 aa  89.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 809 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.64 
 
 		 774 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 703 aa  88.6  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 809 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 687 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.22 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 731 aa  82  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  23.04 
 
 		 717 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  35.77 
 
 		 690 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.75 
 
 		 713 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  24.83 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 721 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 721 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.66 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.5 
 
 		 784 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 788 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  29.76 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  29.76 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 785 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  29.76 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.1 
 
 		 631 aa  62  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.55 
 
 		 651 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 794 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  21.65 
 
 		 807 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  28.68 
 
 		 784 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  28.68 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  27.88 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  26.63 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  26.06 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.19 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  27.56 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  21.03 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.19 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.19 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>