131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4617 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  58.39 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  58.39 
 
 		 285 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  60.29 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  55.6 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  58.02 
 
 		 289 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  55.05 
 
 		 332 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  50.93 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  52.19 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  50.88 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  50.56 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  46.47 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  50.79 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  45.17 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  45.99 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  44.01 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  44.35 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  42.91 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  44.79 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  41.5 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  45.06 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  47.22 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  42.62 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  44.67 
 
 		 516 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  43.16 
 
 		 261 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  37.74 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  42.98 
 
 		 517 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  40.38 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  45.85 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  43.4 
 
 		 517 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  38.58 
 
 		 514 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  42.98 
 
 		 492 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  39.37 
 
 		 514 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  38.58 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  43.46 
 
 		 500 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  38.58 
 
 		 514 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  44.34 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  38.58 
 
 		 514 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  46.29 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  42.17 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  33.8 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  38.72 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  40.49 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  39.81 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  31.06 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  24.86 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.98 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  33.33 
 
 		 490 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.05 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  29.17 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  32.59 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.27 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.37 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.78 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  27.63 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.57 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  24.73 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  30.14 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  25.53 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  30 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.25 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  29.8 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  31.32 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.8 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  29.5 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  36.52 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  25.43 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.5 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  28.09 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.97 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  29.5 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.75 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  29.38 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  33.53 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.3 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  33.91 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.91 
 
 		 607 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  26.04 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  26.39 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.28 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  29.44 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.15 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.15 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.91 
 
 		 548 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  33.1 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  31.01 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  24.54 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  32.28 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  31.65 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  24.54 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  24.54 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.71 
 
 		 524 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  28.57 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.94 
 
 		 502 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>