More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2702 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
271 aa  508  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  61.04 
 
 
286 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  62.77 
 
 
262 aa  225  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  63.24 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  60.24 
 
 
261 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  55.82 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  57.31 
 
 
260 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  57.03 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  56.22 
 
 
272 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  55.91 
 
 
259 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  54.01 
 
 
267 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  56.52 
 
 
260 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  59.04 
 
 
261 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  50.59 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  52.86 
 
 
257 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  45.76 
 
 
276 aa  169  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  58.44 
 
 
269 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  57.2 
 
 
259 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  50.64 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  56.58 
 
 
268 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  51.53 
 
 
262 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  48.08 
 
 
260 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  55.92 
 
 
253 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  55.7 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  56.09 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  49.18 
 
 
261 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  49.18 
 
 
261 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 
266 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  38.24 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  41.9 
 
 
288 aa  122  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.52 
 
 
291 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  38.01 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  43.32 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  43.32 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  43.32 
 
 
291 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  46.83 
 
 
256 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  46.83 
 
 
256 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  43.9 
 
 
255 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  43.52 
 
 
291 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  43.65 
 
 
291 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  43.06 
 
 
291 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  39.52 
 
 
303 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.99 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.06 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  48.61 
 
 
226 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.18 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  38.38 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39.02 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.66 
 
 
2798 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  37.02 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  33.87 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30.83 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  36.29 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  36.1 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  33.77 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  34.08 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.38 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  34.88 
 
 
331 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  32.32 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.03 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  39.04 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  39.45 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.84 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.36 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  37.25 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  36.09 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31.2 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.71 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  31.75 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.74 
 
 
306 aa  72  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.11 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.16 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  31.86 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  31.2 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  41.49 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.89 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  27.68 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  33.46 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  33.58 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.6 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.07 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.98 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  36.09 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  40.22 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  30.42 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.63 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  34 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  29.66 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.14 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  34.12 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.51 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>