196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1869 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  100 
 
 		 502 aa  954    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  44.07 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  44.75 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  46.94 
 
 		 517 aa  309  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  44.44 
 
 		 509 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  37.68 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  37.57 
 
 		 472 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  40.86 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  38.49 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.42 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  38.46 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 468 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  39.62 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  32.83 
 
 		 520 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.24 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.33 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  28.11 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  28.31 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  29.01 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  29.58 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.6 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.89 
 
 		 581 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  26.16 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.56 
 
 		 892 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  29.39 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.56 
 
 		 883 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  26 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.95 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  29.41 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  28.66 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.65 
 
 		 581 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.16 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  23.97 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.33 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.57 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.03 
 
 		 574 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 566 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 568 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.84 
 
 		 592 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.69 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.69 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  27.34 
 
 		 527 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.06 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.04 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  28.16 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.82 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  22.75 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.05 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.53 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.53 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.53 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.05 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.14 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.28 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  31.27 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.88 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.09 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.75 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.93 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.8 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 		 533 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  25.42 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.36 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.85 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  23.23 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.71 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.68 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.2 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.89 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  27 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.48 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.38 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  27.27 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  27.27 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.22 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.99 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.99 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.38 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.99 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.13 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.99 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.84 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>