More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0192 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  100 
 
 		 356 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  98.6 
 
 		 356 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  75.71 
 
 		 356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  71.55 
 
 		 356 aa  547  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  70.99 
 
 		 356 aa  544  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  71.83 
 
 		 357 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  51.88 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  46.07 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  45.22 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  46.07 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  46.07 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  45.71 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.8 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.22 
 
 		 383 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.72 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  43.86 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  45.75 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  44.15 
 
 		 427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  44.15 
 
 		 427 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.44 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  44.6 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  42.66 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  44.48 
 
 		 383 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  44.35 
 
 		 351 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.32 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  45.35 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  44.92 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  42.61 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  44.25 
 
 		 360 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  43.9 
 
 		 387 aa  275  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  43.2 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.23 
 
 		 365 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  43.67 
 
 		 370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  42.9 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.31 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  43.24 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  42.77 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  43.27 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  42.4 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.76 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  41.81 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  41.81 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  41.76 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  41.52 
 
 		 347 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.35 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  41.76 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  41.52 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  44.44 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  41.76 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  40.97 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  44.28 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  40.88 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  42.04 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  45.6 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  41.23 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  41.67 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  40.88 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  41.21 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  41.21 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  42.73 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  45.86 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  44.72 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  40.46 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  42.64 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  43.48 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  41.43 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  40.59 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  42.17 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  39.88 
 
 		 350 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  43.44 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  41.57 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  41.79 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  42.06 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  39.94 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  43.07 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  41.44 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  41.44 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  40.23 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  42.04 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  41.3 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  43.15 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.01 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  43.2 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  42.06 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  41.14 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  42.81 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  40.66 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  41.79 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  40.24 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  41.93 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  41.79 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  42.9 
 
 		 352 aa  252  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  39.35 
 
 		 356 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  41.14 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  39.48 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  41.99 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  42.03 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  41.99 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  40.6 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.37 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>