More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0528 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  67.52 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  54.74 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  44.16 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  45.99 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  38.69 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  40.88 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  37.77 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  39.42 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  38.52 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  38.26 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  37.68 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  36.86 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  35.48 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  37.23 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  37.5 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  37.78 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  37.59 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  35.61 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  34.44 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  35.09 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  35.29 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  36.03 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  34.41 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.96 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  33.46 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  33.58 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  31.85 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.83 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  33.81 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  26.69 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  27.21 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.47 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.74 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.49 
 
 		 190 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.57 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  28.67 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.74 
 
 		 187 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.63 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.07 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.2 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.67 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.24 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.42 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.24 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  24.75 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.84 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.65 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.62 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.4 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.24 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.32 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.64 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.33 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.94 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.96 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.39 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.46 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.37 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.4 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  28.49 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  27.51 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  24.86 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.73 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25.13 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.26 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  21.28 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.26 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.68 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.5 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.27 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.87 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  23.56 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  27.62 
 
 		 458 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  24.31 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.19 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.75 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  22.94 
 
 		 192 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  25.13 
 
 		 184 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  26.27 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  36.92 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.43 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.43 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  27.32 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  21.47 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 65 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  23.37 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25.93 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.89 
 
 		 178 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  22.39 
 
 		 182 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  45 
 
 		 178 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.62 
 
 		 177 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>