More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6897 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 492 aa  968    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  74.34 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  50.61 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  57.05 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  48.87 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  49.12 
 
 		 399 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  48.44 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  52.2 
 
 		 399 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  52.2 
 
 		 399 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  52.2 
 
 		 402 aa  329  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  45.59 
 
 		 398 aa  316  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  46.32 
 
 		 394 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  52.49 
 
 		 331 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  45.82 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  56.49 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  46.13 
 
 		 365 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 362 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  43.71 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  43.15 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  44.97 
 
 		 353 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  44.04 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  44.64 
 
 		 359 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  46.88 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  41.14 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  44.97 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  42.31 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  41.95 
 
 		 379 aa  250  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  41.42 
 
 		 360 aa  250  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  41.99 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  42.77 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  50.2 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  47.24 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  45.32 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  47.24 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  47.24 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  47.94 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  47.64 
 
 		 391 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 380 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  42.32 
 
 		 407 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  47.64 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  48.09 
 
 		 394 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  42.01 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  43.8 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 379 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  41.42 
 
 		 393 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  41.14 
 
 		 363 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  41.42 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  40.42 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  37.91 
 
 		 371 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  44.62 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  40.06 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  44.83 
 
 		 395 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  48.61 
 
 		 360 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  43.07 
 
 		 374 aa  229  9e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  42.32 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  41.41 
 
 		 361 aa  225  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  46.89 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  45.12 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 566 aa  103  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 268 aa  94.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.28 
 
 		 351 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 307 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 308 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  23.44 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  24.27 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.69 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1103 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1107 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  28.65 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 864 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1107 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.8 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>