More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6854 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  38.37 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  45.59 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.22 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 410 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>