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for query gene Franean1_4631 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  450  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  36.65 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  28.7 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  44.93 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 482 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 482 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 434 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.52 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
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NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
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