More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3643 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  50.86 
 
 		 174 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  49.42 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  48.63 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  43.46 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.16 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  43.31 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  44.2 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  42.94 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  45.36 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  44.72 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.01 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.68 
 
 		 231 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  37.71 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  40.72 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 259 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.52 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  35.98 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  39.87 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  53.95 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>