More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1425 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  73.37 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  62.24 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  51.31 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  51.27 
 
 		 254 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 		 272 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  50.81 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  49.73 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  45.09 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  49.2 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  57.04 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  50 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  50.58 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  49.71 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  55.84 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  53.25 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  51.85 
 
 		 291 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  49.11 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  44.55 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  51.68 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  51.68 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  47.14 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  43.62 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  50.91 
 
 		 227 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  42.42 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 		 149 aa  85.5  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  38.18 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.6 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  42.86 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  39.87 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.96 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.36 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.44 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.22 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  37.09 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  36.08 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  40.49 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  42.2 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  52.73 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.69 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>