More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4058 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  100 
 
 
405 aa  833    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31.14 
 
 
401 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.95 
 
 
494 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.25 
 
 
359 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.08 
 
 
489 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.45 
 
 
359 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  23.31 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  30.71 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  29.08 
 
 
498 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  26.78 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.9 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  23.41 
 
 
466 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.68 
 
 
566 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.19 
 
 
533 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.56 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.55 
 
 
595 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.11 
 
 
600 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.98 
 
 
567 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  25 
 
 
383 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  28.28 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.2 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  29.72 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  24.32 
 
 
383 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  24.32 
 
 
388 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  28.16 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  24.32 
 
 
388 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.08 
 
 
601 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.78 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  24.79 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  26.24 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.3 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  25.33 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.11 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.11 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.94 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.11 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.6 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.5 
 
 
588 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.63 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  28.82 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  30.09 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.16 
 
 
559 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.46 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  28.7 
 
 
531 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.39 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  24.93 
 
 
822 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  25.14 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.02 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.02 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.95 
 
 
519 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  29.43 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  25.65 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  24.57 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  26.91 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  25.39 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  27.95 
 
 
519 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.07 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  28.11 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  22.51 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  23.42 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  26.21 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  22.84 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  23.27 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.84 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  25.21 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  25.27 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.01 
 
 
513 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  25.51 
 
 
440 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.16 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  26.06 
 
 
330 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.14 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  32.14 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.36 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.67 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.4 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.45 
 
 
464 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  25.78 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.52 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  24.13 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  24.64 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  26.52 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.78 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  20.18 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.09 
 
 
793 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  24.73 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.52 
 
 
369 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  24.73 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25.66 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.07 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.55 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.5 
 
 
484 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  28.91 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  23.29 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  21.3 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.15 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  25.14 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.15 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.15 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.15 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>