More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1306 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 763 aa  1563    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.19 
 
 		 953 aa  489  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.05 
 
 		 802 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.97 
 
 		 929 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 		 769 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 1677 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  40.87 
 
 		 757 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  40.62 
 
 		 803 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 836 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 785 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.09 
 
 		 812 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  39.66 
 
 		 635 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 748 aa  353  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 1004 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 709 aa  343  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.42 
 
 		 1004 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.67 
 
 		 777 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 691 aa  326  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 819 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 901 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 1134 aa  317  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 482 aa  315  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  44.99 
 
 		 1452 aa  313  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  45.89 
 
 		 356 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.52 
 
 		 916 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  42.54 
 
 		 1177 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 976 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 917 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 752 aa  264  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 753 aa  253  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  34.32 
 
 		 882 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 576 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  35.35 
 
 		 738 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1040 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 886 aa  237  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 703 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 873 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 914 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1122 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 810 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 997 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 997 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1184 aa  234  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1184 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 859 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 869 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  38.41 
 
 		 1788 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 869 aa  231  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 714 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 802 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 559 aa  228  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 886 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 829 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1193 aa  227  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1023 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 841 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 817 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 759 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1023 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  31.24 
 
 		 1268 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1418 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 860 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1021 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.01 
 
 		 890 aa  220  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 803 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 926 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 871 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 819 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 857 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  32.28 
 
 		 812 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 912 aa  218  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 926 aa  218  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 849 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 677 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 935 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0586  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 913 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 682 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 838 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1076 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 540 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 874 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 		 746 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 936 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 846 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 655 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 1070 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 619 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 		 844 aa  210  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1070 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 981 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 647 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 673 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 721 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 634 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  33.65 
 
 		 866 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1105 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>