More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2770 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  100 
 
 		 467 aa  946    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  42.61 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  43.13 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  42.49 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  43.04 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  42 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  41.11 
 
 		 468 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  41.11 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  41.51 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  41.33 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  41.11 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  40.9 
 
 		 468 aa  358  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  40.34 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  40.9 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  40.47 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  39.05 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  41.15 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  36.89 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  36.89 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  35.28 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  35.53 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  35.67 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  36.29 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  35.82 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  36.31 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  36.24 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  36.25 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  32.84 
 
 		 471 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  33.98 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.06 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  33.83 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.5 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  33.82 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.51 
 
 		 438 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  34.72 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  33.33 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  30.9 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  31.67 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  34.26 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  28.41 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  30.21 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  26.57 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  26.48 
 
 		 576 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  26.56 
 
 		 576 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.92 
 
 		 592 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.02 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  27.31 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  30.39 
 
 		 525 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.8 
 
 		 578 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.54 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.89 
 
 		 585 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.67 
 
 		 576 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.67 
 
 		 576 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.2 
 
 		 508 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  27.21 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  25.31 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.98 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  27.95 
 
 		 547 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  25.85 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  27.47 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  26.99 
 
 		 547 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  25.62 
 
 		 579 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  26.47 
 
 		 579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.01 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.25 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  32.28 
 
 		 591 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.93 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  24.58 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  45.26 
 
 		 108 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  24.68 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  24.71 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  23.85 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  37.61 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.43 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.16 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  28.82 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.01 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  25.55 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.72 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  43.06 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.49 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  49.28 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  26.5 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  43.75 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.06 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  26.5 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.25 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.25 
 
 		 419 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.25 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  38.6 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.06 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.58 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.6 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  46.91 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  26.67 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  46.91 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.44 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>