95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2337 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  100 
 
 		 1147 aa  2295    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  46.2 
 
 		 646 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  42.63 
 
 		 1668 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  37.32 
 
 		 1449 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  40.98 
 
 		 495 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  40.91 
 
 		 336 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  41.57 
 
 		 341 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  42.39 
 
 		 1003 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.76 
 
 		 755 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  43.09 
 
 		 1433 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  38.71 
 
 		 491 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  32.84 
 
 		 571 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  41.42 
 
 		 1437 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  35.8 
 
 		 340 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0182  hypothetical protein  35.16 
 
 		 647 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  36.87 
 
 		 1174 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  37.5 
 
 		 657 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  37.22 
 
 		 501 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  27.32 
 
 		 1483 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  38.81 
 
 		 700 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  37.76 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  36.31 
 
 		 324 aa  118  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  34.18 
 
 		 541 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  34.86 
 
 		 371 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  36.72 
 
 		 362 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.8 
 
 		 1773 aa  111  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  34.01 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  39.41 
 
 		 333 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  36.81 
 
 		 1296 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.96 
 
 		 558 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  31.82 
 
 		 736 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  33.84 
 
 		 408 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  31.67 
 
 		 803 aa  94.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  32.22 
 
 		 477 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.71 
 
 		 543 aa  92  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1898 aa  90.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  49.43 
 
 		 308 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.3 
 
 		 665 aa  90.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.9 
 
 		 900 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1215 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  33.33 
 
 		 634 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.46 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.14 
 
 		 1015 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.31 
 
 		 366 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  34.57 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  29.63 
 
 		 996 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1055 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.66 
 
 		 1575 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1294 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  33.86 
 
 		 808 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  33.07 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  33.67 
 
 		 647 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  34.5 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.35 
 
 		 846 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  38.95 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  32.07 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  28.41 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.73 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  31.33 
 
 		 347 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.58 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  29.96 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  32.7 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  32.8 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  27.66 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.3 
 
 		 933 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.04 
 
 		 687 aa  68.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  31.21 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  32.91 
 
 		 702 aa  68.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  28.43 
 
 		 876 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.84 
 
 		 398 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  27.65 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 		 1783 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1318 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  28.42 
 
 		 254 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1087 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  26.5 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  30.49 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  30.42 
 
 		 703 aa  60.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  28.22 
 
 		 221 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 		 1797 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  34.05 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  29.15 
 
 		 2833 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  38.17 
 
 		 627 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  26.16 
 
 		 725 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.99 
 
 		 6497 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  37.88 
 
 		 726 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2356  hypothetical protein  29.31 
 
 		 496 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  35.62 
 
 		 1337 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  26.92 
 
 		 3958 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  28.68 
 
 		 621 aa  45.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>