122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1559 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1559  peptidase M61 domain protein  100 
 
 		 621 aa  1282    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2360  peptidase M61 domain-containing protein  45.82 
 
 		 617 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07485  hypothetical protein  40.35 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0867062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3352  peptidase M61 domain protein  27.13 
 
 		 598 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  23.29 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.3 
 
 		 600 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  22.5 
 
 		 587 aa  120  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  26.31 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  23.68 
 
 		 600 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  22.35 
 
 		 594 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  22.65 
 
 		 600 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  25.31 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  23.41 
 
 		 599 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  23.72 
 
 		 622 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  23.41 
 
 		 599 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  24.95 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  22.14 
 
 		 594 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  23.55 
 
 		 599 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  23.72 
 
 		 599 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  24.41 
 
 		 612 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  24.33 
 
 		 591 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  24.41 
 
 		 609 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  24.5 
 
 		 609 aa  107  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  23.89 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  24.07 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  23.22 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  24.38 
 
 		 618 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  24.41 
 
 		 609 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  24.41 
 
 		 609 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  24.41 
 
 		 609 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  24.41 
 
 		 609 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  23.11 
 
 		 597 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  23.35 
 
 		 593 aa  103  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  22.36 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  23.25 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  22.16 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  23.93 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  22.3 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  22.36 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  22.89 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  22.85 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  23.23 
 
 		 578 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  23.57 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  23.9 
 
 		 587 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  23.61 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  23.44 
 
 		 588 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  23.38 
 
 		 588 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  23.9 
 
 		 590 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  22.86 
 
 		 623 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  21.4 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  25.1 
 
 		 592 aa  95.1  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  22.89 
 
 		 585 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  21.8 
 
 		 598 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  25.45 
 
 		 584 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  23.38 
 
 		 623 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  20.3 
 
 		 596 aa  94  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  23.17 
 
 		 497 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  22.46 
 
 		 602 aa  94  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  23.12 
 
 		 598 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  22.86 
 
 		 588 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  22.1 
 
 		 604 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  25.48 
 
 		 585 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  21.8 
 
 		 608 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1205  peptidase M61 domain protein  24.34 
 
 		 606 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.440173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  23.16 
 
 		 621 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  22.55 
 
 		 601 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  24.61 
 
 		 584 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  22.9 
 
 		 588 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  23.08 
 
 		 588 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  23.43 
 
 		 613 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  22.41 
 
 		 588 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  22.81 
 
 		 592 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  22.25 
 
 		 588 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  24.15 
 
 		 584 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  21.52 
 
 		 602 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  23.87 
 
 		 585 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  23.47 
 
 		 597 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  21.71 
 
 		 601 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  20.33 
 
 		 610 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  21.51 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  21.73 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  23.08 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  23.14 
 
 		 617 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  22.9 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  23.14 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  22.7 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  20.83 
 
 		 608 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  21.22 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  24.04 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  21.92 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  22.33 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  22.4 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  22.9 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  22.56 
 
 		 616 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  20.48 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  24.16 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  23.01 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  22.49 
 
 		 603 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  20.71 
 
 		 631 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  22.27 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>