129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2077 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 327 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  35.65 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.95 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.09 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.52 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.25 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.71 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.06 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.31 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.34 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.34 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.96 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.86 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.94 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  32.58 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  32.31 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.25 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.25 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.36 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  29.19 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.65 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.96 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.73 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.63 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.02 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.69 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25.98 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.38 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.68 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.41 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.73 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.54 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>