More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4482 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  99.13 
 
 		 1509 aa  2764    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  42.2 
 
 		 1679 aa  1031    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1791 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  95.29 
 
 		 1525 aa  2651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1528 aa  3108    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1770 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1490 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  32.82 
 
 		 1411 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1426 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1411 aa  631  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  34.57 
 
 		 1426 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  32.69 
 
 		 1411 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1411 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  33.91 
 
 		 1397 aa  629  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1426 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  34.24 
 
 		 1400 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  32.93 
 
 		 1411 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 1268 aa  628  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1397 aa  629  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  33.87 
 
 		 1377 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  34.05 
 
 		 1397 aa  626  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  33.61 
 
 		 1308 aa  625  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  33.89 
 
 		 1394 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.1 
 
 		 1398 aa  622  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.75 
 
 		 1399 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  32.48 
 
 		 1411 aa  623  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  34.04 
 
 		 1429 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1377 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  33.7 
 
 		 1409 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  34.1 
 
 		 1397 aa  619  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  33.61 
 
 		 1388 aa  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  34.14 
 
 		 1410 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  33.96 
 
 		 1405 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1251 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.92 
 
 		 1365 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  33.47 
 
 		 1417 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  32.01 
 
 		 1388 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  32.47 
 
 		 1415 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  43 
 
 		 1677 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1319 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1317 aa  506  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1216 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  32.79 
 
 		 1200 aa  499  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1199 aa  492  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.4 
 
 		 1604 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1586 aa  340  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1620 aa  331  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1583 aa  323  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.19 
 
 		 1626 aa  314  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.49 
 
 		 1609 aa  308  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.38 
 
 		 1348 aa  301  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.26 
 
 		 1362 aa  297  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1419 aa  283  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.15 
 
 		 1446 aa  279  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.93 
 
 		 1421 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1531 aa  274  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1602 aa  273  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 1981 aa  270  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1654 aa  266  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.74 
 
 		 1530 aa  261  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1554 aa  259  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.58 
 
 		 1429 aa  254  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  35.83 
 
 		 713 aa  251  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1547 aa  250  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.43 
 
 		 1385 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1400 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.56 
 
 		 1411 aa  245  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.26 
 
 		 1560 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1550 aa  239  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1229 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1520 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  30.79 
 
 		 682 aa  227  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1386 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1410 aa  222  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.82 
 
 		 1593 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.82 
 
 		 1379 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.95 
 
 		 1434 aa  218  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1551 aa  218  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1527 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1409 aa  213  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.64 
 
 		 1568 aa  201  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.11 
 
 		 1428 aa  194  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 866 aa  191  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  31.46 
 
 		 586 aa  189  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1418 aa  188  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1140 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  33.81 
 
 		 554 aa  186  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.98 
 
 		 1485 aa  185  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1390 aa  184  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1402 aa  184  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.49 
 
 		 1573 aa  180  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  33.65 
 
 		 502 aa  180  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.67 
 
 		 2096 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  33.89 
 
 		 477 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  34.17 
 
 		 477 aa  175  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  34.17 
 
 		 477 aa  175  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  31.72 
 
 		 855 aa  175  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  34.17 
 
 		 477 aa  175  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  34.17 
 
 		 477 aa  175  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>