183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0893 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 644 aa  1241    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.52 
 
 		 1019 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.32 
 
 		 1222 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.18 
 
 		 2194 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.03 
 
 		 1118 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.75 
 
 		 889 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.18 
 
 		 1340 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.42 
 
 		 1009 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.32 
 
 		 1225 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.08 
 
 		 1113 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  33.62 
 
 		 1838 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.91 
 
 		 412 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.24 
 
 		 2807 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  36.8 
 
 		 662 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.93 
 
 		 1012 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.2 
 
 		 616 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.41 
 
 		 891 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.7 
 
 		 1557 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.55 
 
 		 828 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  30.7 
 
 		 872 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  30.95 
 
 		 813 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  35.44 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.16 
 
 		 4379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.16 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1289 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  37.4 
 
 		 1426 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.36 
 
 		 1126 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.92 
 
 		 1490 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.43 
 
 		 663 aa  87.8  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  40.26 
 
 		 558 aa  87.4  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  35.52 
 
 		 699 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  42.14 
 
 		 190 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50.57 
 
 		 2851 aa  80.1  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.98 
 
 		 1275 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  35.02 
 
 		 1421 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.39 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  41.1 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  53.25 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  37.04 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  51.35 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  43.61 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.86 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.61 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 2082 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  44.33 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46.91 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  50.6 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.87 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.64 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  47.5 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.32 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  33.11 
 
 		 400 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  29.57 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.67 
 
 		 1736 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.31 
 
 		 726 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  38.84 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.05 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.84 
 
 		 3197 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  34.24 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  51.9 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  43.48 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  43.37 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  33.11 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  43.37 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  43.37 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  23.21 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  49.37 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  43.37 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50 
 
 		 2914 aa  57.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  42.99 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  50.72 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  48.61 
 
 		 380 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  48.28 
 
 		 643 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  44.3 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  50.7 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  38.64 
 
 		 303 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  52.44 
 
 		 712 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 		 308 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  46.99 
 
 		 222 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  39.22 
 
 		 587 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  46.51 
 
 		 307 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  43.66 
 
 		 767 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  54.3  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.21 
 
 		 319 aa  54.3  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  46.32 
 
 		 813 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  45.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  47.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  47.14 
 
 		 438 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 1127 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.86 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  46.84 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  45.35 
 
 		 835 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  42.16 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  46.84 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  38.81 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  47.14 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  45.71 
 
 		 542 aa  53.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>