90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0425 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  100 
 
 
660 aa  1290    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  25 
 
 
1140 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4032  hypothetical protein  30.45 
 
 
484 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.786838  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  46.27 
 
 
734 aa  57.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  50 
 
 
938 aa  55.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  36.36 
 
 
669 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  43.66 
 
 
3197 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6926  hypothetical protein  23.66 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  26.2 
 
 
500 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  46.3 
 
 
1057 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  53.57 
 
 
1565 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  50 
 
 
816 aa  51.6  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  53.33 
 
 
487 aa  50.8  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  42.19 
 
 
873 aa  50.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  38.33 
 
 
948 aa  50.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  30.43 
 
 
938 aa  50.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  54.1 
 
 
719 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  48.98 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  45.83 
 
 
814 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  44.07 
 
 
3197 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.98 
 
 
639 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  52.17 
 
 
777 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  52.08 
 
 
712 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  46 
 
 
780 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.54 
 
 
953 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  39.29 
 
 
677 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  47.62 
 
 
2066 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.08 
 
 
402 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  51.02 
 
 
884 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  38.46 
 
 
943 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  36.17 
 
 
823 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  34.43 
 
 
824 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 
1732 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6383  hypothetical protein  23.19 
 
 
507 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1445  hypothetical protein  23.19 
 
 
507 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  42.67 
 
 
552 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  55.81 
 
 
778 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7047  hypothetical protein  22.83 
 
 
507 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  55.81 
 
 
778 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  55.81 
 
 
778 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  55.81 
 
 
778 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  47.5 
 
 
948 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  40.32 
 
 
971 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  50 
 
 
948 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  57.89 
 
 
871 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  40 
 
 
944 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 
2554 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  40 
 
 
944 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  40 
 
 
944 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  53.06 
 
 
910 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03410  conserved repeat protein  50 
 
 
572 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  51.06 
 
 
600 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  35.82 
 
 
945 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 
944 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  50 
 
 
1916 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  41.38 
 
 
1231 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  41.82 
 
 
940 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.1 
 
 
945 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2716  PKD domain containing protein  52.08 
 
 
664 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575961  normal  0.0544825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  38.46 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  38.46 
 
 
1027 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
940 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.94 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  40 
 
 
951 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  43.08 
 
 
1123 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  57.89 
 
 
867 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  49.02 
 
 
705 aa  45.8  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  38.98 
 
 
929 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  50 
 
 
1150 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 
3295 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.94 
 
 
947 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  47.17 
 
 
317 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  38.16 
 
 
840 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  37.5 
 
 
960 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  55.26 
 
 
871 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40 
 
 
685 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.46 
 
 
1667 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  41.18 
 
 
658 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  52.94 
 
 
892 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5720  hypothetical protein  22.91 
 
 
501 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131823  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  55.26 
 
 
865 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  34.07 
 
 
1282 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  39.22 
 
 
581 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.9 
 
 
1842 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  44.44 
 
 
775 aa  44.3  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  32.38 
 
 
965 aa  44.3  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  45 
 
 
948 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11488  serine protease, subtilase family protein  38.1 
 
 
312 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.26 
 
 
673 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.25 
 
 
942 aa  43.9  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>