57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0220 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  100 
 
 		 705 aa  1423    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.73 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  51.62 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.12 
 
 		 1016 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.02 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  51.91 
 
 		 1844 aa  350  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  50 
 
 		 411 aa  330  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.26 
 
 		 396 aa  319  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.66 
 
 		 394 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  45.1 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.47 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 		 457 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  49.44 
 
 		 394 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.13 
 
 		 398 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.07 
 
 		 447 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  47.12 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.52 
 
 		 401 aa  290  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  44.44 
 
 		 410 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  35.16 
 
 		 454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  34.7 
 
 		 454 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  37.98 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  38.76 
 
 		 464 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  37.86 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.46 
 
 		 341 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  34.74 
 
 		 374 aa  171  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  34.67 
 
 		 350 aa  169  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 279 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  32.78 
 
 		 309 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  32.51 
 
 		 309 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1087 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0074  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 		 1133 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1169  hypothetical protein  30.64 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  53.57 
 
 		 98 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  45 
 
 		 867 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  38.27 
 
 		 938 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  43.33 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  37.31 
 
 		 317 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  38.03 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  38.03 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  32.53 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  38.03 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  39.06 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  32.89 
 
 		 871 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  40 
 
 		 865 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30.51 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  35.56 
 
 		 677 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  39.51 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.63 
 
 		 953 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  49.02 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  24.57 
 
 		 1104 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  48.84 
 
 		 775 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  38.46 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  27.73 
 
 		 777 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  36.36 
 
 		 1463 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  37.66 
 
 		 1194 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  27.49 
 
 		 2706 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.16 
 
 		 1029 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>