30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2941 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
396 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.76 
 
 
672 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  55 
 
 
411 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.96 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.97 
 
 
1016 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  52.48 
 
 
1844 aa  362  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.03 
 
 
424 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.92 
 
 
391 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 
457 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  47.99 
 
 
705 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  45.01 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  44.16 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.34 
 
 
394 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.75 
 
 
401 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.29 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.96 
 
 
447 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  44.16 
 
 
410 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  41.96 
 
 
404 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  33.69 
 
 
454 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  34.73 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  40.22 
 
 
350 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  35.21 
 
 
464 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  35.15 
 
 
472 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  38.32 
 
 
374 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  33.8 
 
 
463 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.56 
 
 
341 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.54 
 
 
279 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  35.53 
 
 
309 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  35.53 
 
 
309 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  57.32 
 
 
98 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>