30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2523 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  46.31 
 
 		 374 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.51 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.24 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.54 
 
 		 672 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.27 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.88 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.06 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  48.02 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  47.72 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 		 1016 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.71 
 
 		 279 aa  215  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  35.53 
 
 		 1844 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  37.27 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.68 
 
 		 401 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  30.67 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  32.26 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.77 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.57 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  32.75 
 
 		 705 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 		 447 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  29.61 
 
 		 404 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  27.27 
 
 		 472 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  28.57 
 
 		 454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  27.89 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  26.96 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  26.36 
 
 		 454 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  49.44 
 
 		 98 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>